Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AGRNO00468 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AGRNO00468 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AGRNO00468 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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