Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DCTN6O00399 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DCTN6O00399 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms