Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CENPBD1B2RD01 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms