Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF487B1APH4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF487B1APH4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms