Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRAMEF22A3QJZ6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms