Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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HCN4Q9Y3Q4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HCN4Q9Y3Q4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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HCN4Q9Y3Q4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HCN4Q9Y3Q4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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