Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THRAP3Q9Y2W1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRAP3Q9Y2W1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms