Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SALL4Q9UJQ4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms