Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms