Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HMG20BQ9P0W2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMG20BQ9P0W2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms