Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDP1Q9P0J1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms