Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZDHHC3Q9NYG2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms