Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GDAP2Q9NXN4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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