Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DNAJC28Q9NX36 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms