Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FANCLQ9NW38 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms