Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms