Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNTG1Q9NSN8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms