Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT82Q9NSB4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms