Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LHX9Q9NQ69 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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