Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFDQ9GZP0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDGFDQ9GZP0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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