Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRIM8Q9BZR9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRIM8Q9BZR9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms