Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM54Q9BYV2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms