Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNG6Q9BXT2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms