Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYCP2Q9BX26 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms