Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms