Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NDFIP1Q9BT67 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms