Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EBF4Q9BQW3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EBF4Q9BQW3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms