Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TUBA1CQ9BQE3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms