Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USB1Q9BQ65 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms