Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GCNAQ96QF7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCNAQ96QF7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms