Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms