Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COG8Q96MW5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms