Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPNS2Q96L46 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPNS2Q96L46 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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