Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC136Q96JN2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms