Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTV1Q96GA3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTV1Q96GA3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms