Protein–RNA interactions for Protein: Q96FH0

BORCS8, BLOC-1-related complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS8Q96FH0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BORCS8Q96FH0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BORCS8Q96FH0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms