Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC11Q96DB2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms