Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms