Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC12Q8WUD4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms