Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MCOLN3Q8TDD5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MCOLN3Q8TDD5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms