Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHM5

KDM2B, Lysine-specific demethylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2BQ8NHM5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2BQ8NHM5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms