Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms