Protein–RNA interactions for Protein: Q8N841

TTLL6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL6Q8N841 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL6Q8N841 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL6Q8N841 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL6Q8N841 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms