Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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