Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LMNTD2Q8IXW0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LMNTD2Q8IXW0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms