Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD163Q86VB7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms