Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PREX2Q70Z35 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PREX2Q70Z35 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms