Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FAM43BQ6ZT52 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FAM43BQ6ZT52 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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