Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CASC2Q6XLA1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms