Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.63
HRCT1Q6UXD1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HRCT1Q6UXD1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms